Biblio

Zinc Fingers

C. M. Karch, Ezerskiy, L. A., Bertelsen, S., and Goate, A. M., “Alzheimer's Disease Risk Polymorphisms Regulate Gene Expression in the ZCWPW1 and the CELF1 Loci.”, PLoS One, vol. 11, no. 2, p. e0148717, 2016.

Urokinase-Type Plasminogen Activator

N. Ertekin-Taner, Ronald, J., Feuk, L., Prince, J., Tucker, M., Younkin, L., Hella, M., Jain, S., Hackett, A., Scanlin, L., Kelly, J., Kihiko-Ehman, M., Neltner, M., Hersh, L., Kindy, M., Markesbery, W., Hutton, M., de Andrade, M., Petersen, R. C., Graff-Radford, N., Estus, S., Brookes, A. J., and Younkin, S. G., “Elevated amyloid beta protein (Abeta42) and late onset Alzheimer's disease are associated with single nucleotide polymorphisms in the urokinase-type plasminogen activator gene.”, Hum Mol Genet, vol. 14, no. 3, pp. 447-60, 2005.

United States

G. C. Román, Tatemichi, T. K., Erkinjuntti, T., Cummings, J. L., Masdeu, J. C., Garcia, J. H., Amaducci, L., Orgogozo, J. M., Brun, A., and Hofman, A., “Vascular dementia: diagnostic criteria for research studies. Report of the NINDS-AIREN International Workshop.”, Neurology, vol. 43, no. 2, pp. 250-60, 1993.

L. - San Wang, Naj, A. C., Graham, R. R., Crane, P. K., Kunkle, B. W., Cruchaga, C., Murcia, J. D. Gonzalez, Cannon-Albright, L., Baldwin, C. T., Zetterberg, H., Blennow, K., Kukull, W. A., Faber, K. M., Schupf, N., Norton, M. C., Tschanz, J. A. T., Munger, R. G., Corcoran, C. D., Rogaeva, E., Lin, C. - F., Dombroski, B. A., Cantwell, L. B., Partch, A., Valladares, O., Hakonarson, H., St George-Hyslop, P., Green, R. C., Goate, A. M., Foroud, T. M., Carney, R. M., Larson, E. B., Behrens, T. W., Kauwe, J. S. K., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Schellenberg, G. D., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barmada, M., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beecham, G. W., Beekly, D., Bennett, D. A., Bigio, E. H., Bird, T. D., Blacker, D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., F Demirci, Y., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Ertekin-Taner, N., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Graff-Radford, N. R., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Hamilton-Nelson, K. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Jun, G., Jun, G., M Kamboh, I., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Marson, D. C., Martin, E. R., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., W Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Montine, T. J., Morris, J. C., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Parisi, J. E., Perry, W., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reiman, E. M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Tsuang, D. W., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Rarity of the Alzheimer disease-protective APP A673T variant in the United States.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 2, pp. 209-16, 2015.

P. M. Erlich, Lunetta, K. L., L Cupples, A., Huyck, M., Green, R. C., Baldwin, C. T., and Farrer, L. A., “Polymorphisms in the PON gene cluster are associated with Alzheimer disease.”, Hum Mol Genet, vol. 15, no. 1, pp. 77-85, 2006.

Transcriptome

M. Wang, Beckmann, N. D., Roussos, P., Wang, E., Zhou, X., Wang, Q., Ming, C., Neff, R., Ma, W., Fullard, J. F., Hauberg, M. E., Bendl, J., Peters, M. A., Logsdon, B., Wang, P., Mahajan, M., Mangravite, L. M., Dammer, E. B., Duong, D. M., Lah, J. J., Seyfried, N. T., Levey, A. I., Buxbaum, J. D., Ehrlich, M., Gandy, S., Katsel, P., Haroutunian, V., Schadt, E., and Zhang, B., “The Mount Sinai cohort of large-scale genomic, transcriptomic and proteomic data in Alzheimer's disease.”, Sci Data, vol. 5, p. 180185, 2018.

Transcription, Genetic

P. - T. Xu, Li, Y. - J., Qin, X. - J., Scherzer, C. R., Xu, H., Schmechel, D. E., Hulette, C. M., Ervin, J., Gullans, S. R., Haines, J., Pericak-Vance, M. A., and Gilbert, J. R., “Differences in apolipoprotein E3/3 and E4/4 allele-specific gene expression in hippocampus in Alzheimer disease.”, Neurobiol Dis, vol. 21, no. 2, pp. 256-75, 2006.

Transcription Factors

K. - L. Huang, Marcora, E., Pimenova, A. A., Di Narzo, A. F., Kapoor, M., Jin, S. Chih, Harari, O., Bertelsen, S., Fairfax, B. P., Czajkowski, J., Chouraki, V., Grenier-Boley, B., Bellenguez, C., Deming, Y., McKenzie, A., Raj, T., Renton, A. E., Budde, J., Smith, A., Fitzpatrick, A., Bis, J. C., DeStefano, A., Adams, H. H. H., M Ikram, A., van der Lee, S., Del-Aguila, J. L., Fernández, M. Victoria, Ibañez, L., Sims, R., Escott-Price, V., Mayeux, R., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Lambert, J. Charles, van Duijn, C., Launer, L., Seshadri, S., Williams, J., Amouyel, P., Schellenberg, G. D., Zhang, B., Borecki, I., Kauwe, J. S. K., Cruchaga, C., Hao, K., and Goate, A. M., “A common haplotype lowers PU.1 expression in myeloid cells and delays onset of Alzheimer's disease.”, Nat Neurosci, vol. 20, no. 8, pp. 1052-1061, 2017.

Trans-Activators

K. - L. Huang, Marcora, E., Pimenova, A. A., Di Narzo, A. F., Kapoor, M., Jin, S. Chih, Harari, O., Bertelsen, S., Fairfax, B. P., Czajkowski, J., Chouraki, V., Grenier-Boley, B., Bellenguez, C., Deming, Y., McKenzie, A., Raj, T., Renton, A. E., Budde, J., Smith, A., Fitzpatrick, A., Bis, J. C., DeStefano, A., Adams, H. H. H., M Ikram, A., van der Lee, S., Del-Aguila, J. L., Fernández, M. Victoria, Ibañez, L., Sims, R., Escott-Price, V., Mayeux, R., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Lambert, J. Charles, van Duijn, C., Launer, L., Seshadri, S., Williams, J., Amouyel, P., Schellenberg, G. D., Zhang, B., Borecki, I., Kauwe, J. S. K., Cruchaga, C., Hao, K., and Goate, A. M., “A common haplotype lowers PU.1 expression in myeloid cells and delays onset of Alzheimer's disease.”, Nat Neurosci, vol. 20, no. 8, pp. 1052-1061, 2017.

Tomography, X-Ray Computed

G. C. Román, Tatemichi, T. K., Erkinjuntti, T., Cummings, J. L., Masdeu, J. C., Garcia, J. H., Amaducci, L., Orgogozo, J. M., Brun, A., and Hofman, A., “Vascular dementia: diagnostic criteria for research studies. Report of the NINDS-AIREN International Workshop.”, Neurology, vol. 43, no. 2, pp. 250-60, 1993.

Temporal Lobe

F. Zou, Chai, H. Seng, Younkin, C. S., Allen, M., Crook, J., V Pankratz, S., Carrasquillo, M. M., Rowley, C. N., Nair, A. A., Middha, S., Maharjan, S., Nguyen, T., Ma, L., Malphrus, K. G., Palusak, R., Lincoln, S., Bisceglio, G., Georgescu, C., Kouri, N., Kolbert, C. P., Jen, J., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Farrer, L. A., Schellenberg, G. D., Petersen, R. C., Graff-Radford, N. R., Dickson, D. W., Younkin, S. G., and Ertekin-Taner, N., “Brain expression genome-wide association study (eGWAS) identifies human disease-associated variants.”, PLoS Genet, vol. 8, no. 6, p. e1002707, 2012.

tau Proteins

P. L. Kramer, Xu, H., Woltjer, R. L., Westaway, S. K., Clark, D., Erten-Lyons, D., Kaye, J. A., Welsh-Bohmer, K. A., Troncoso, J. C., Markesbery, W. R., Petersen, R. C., R Turner, S., Kukull, W. A., Bennett, D. A., Galasko, D., Morris, J. C., and Ott, J., “Alzheimer disease pathology in cognitively healthy elderly: a genome-wide study.”, Neurobiol Aging, vol. 32, no. 12, pp. 2113-22, 2011.

G. Jun, Ibrahim-Verbaas, C. A., Vronskaya, M., Lambert, J. - C., Chung, J., Naj, A. C., Kunkle, B. W., Wang, L. - S., Bis, J. C., Bellenguez, C., Harold, D., Lunetta, K. L., Destefano, A. L., Grenier-Boley, B., Sims, R., Beecham, G. W., Smith, A. V., Chouraki, V., Hamilton-Nelson, K. L., Ikram, M. A., Fievet, N., Denning, N., Martin, E. R., Schmidt, H., Kamatani, Y., Dunstan, M. L., Valladares, O., Laza, A. R., Zelenika, D., Ramirez, A., Foroud, T. M., Choi, S. - H., Boland, A., Becker, T., Kukull, W. A., van der Lee, S. J., Pasquier, F., Cruchaga, C., Beekly, D., Fitzpatrick, A. L., Hanon, O., Gill, M., Barber, R., Gudnason, V., Campion, D., Love, S., Bennett, D. A., Amin, N., Berr, C., Tsolaki, M., Buxbaum, J. D., Lopez, O. L., Deramecourt, V., Fox, N. C., Cantwell, L. B., Tárraga, L., Dufouil, C., Hardy, J., Crane, P. K., Eiriksdottir, G., Hannequin, D., Clarke, R., Evans, D., Mosley, T. H., Letenneur, L., Brayne, C., Maier, W., De Jager, P., Emilsson, V., Dartigues, J. - F., Hampel, H., Kamboh, M. I., de Bruijn, R. F. A. G., Tzourio, C., Pastor, P., Larson, E. B., Rotter, J. I., O'Donovan, M. C., Montine, T. J., Nalls, M. A., Mead, S., Reiman, E. M., Jonsson, P. V., Holmes, C., St George-Hyslop, P. H., Boada, M., Passmore, P., Wendland, J. R., Schmidt, R., Morgan, K., Winslow, A. R., Powell, J. F., Carasquillo, M., Younkin, S. G., Jakobsdóttir, J., Kauwe, J. S. K., Wilhelmsen, K. C., Rujescu, D., Nöthen, M. M., Hofman, A., Jones, L., Haines, J. L., Psaty, B. M., Van Broeckhoven, C., Holmans, P., Launer, L. J., Mayeux, R., Lathrop, M., Goate, A. M., Escott-Price, V., Seshadri, S., Pericak-Vance, M. A., Amouyel, P., Williams, J., van Duijn, C. M., Schellenberg, G. D., and Farrer, L. A., “A novel Alzheimer disease locus located near the gene encoding tau protein.”, Mol Psychiatry, vol. 21, no. 1, pp. 108-17, 2016.

Synucleins

Y. Trembath, Rosenberg, C., Ervin, J. F., Schmechel, D. E., Gaskell, P., Pericak-Vance, M., Vance, J., and Hulette, C. M., “Lewy body pathology is a frequent co-pathology in familial Alzheimer's disease.”, Acta Neuropathol, vol. 105, no. 5, pp. 484-8, 2003.

Symporters

J. Mez, Chung, J., Jun, G., Kriegel, J., Bourlas, A. P., Sherva, R., Logue, M. W., Barnes, L. L., Bennett, D. A., Buxbaum, J. D., Byrd, G. S., Crane, P. K., Ertekin-Taner, N., Evans, D., M Fallin, D., Foroud, T., Goate, A., Graff-Radford, N. R., Hall, K. S., M Kamboh, I., Kukull, W. A., Larson, E. B., Manly, J. J., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G. D., Lunetta, K. L., and Farrer, L. A., “Two novel loci, COBL and SLC10A2, for Alzheimer's disease in African Americans.”, Alzheimers Dement, vol. 13, no. 2, pp. 119-129, 2017.

Sweden

L. - San Wang, Naj, A. C., Graham, R. R., Crane, P. K., Kunkle, B. W., Cruchaga, C., Murcia, J. D. Gonzalez, Cannon-Albright, L., Baldwin, C. T., Zetterberg, H., Blennow, K., Kukull, W. A., Faber, K. M., Schupf, N., Norton, M. C., Tschanz, J. A. T., Munger, R. G., Corcoran, C. D., Rogaeva, E., Lin, C. - F., Dombroski, B. A., Cantwell, L. B., Partch, A., Valladares, O., Hakonarson, H., St George-Hyslop, P., Green, R. C., Goate, A. M., Foroud, T. M., Carney, R. M., Larson, E. B., Behrens, T. W., Kauwe, J. S. K., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Schellenberg, G. D., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barmada, M., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beecham, G. W., Beekly, D., Bennett, D. A., Bigio, E. H., Bird, T. D., Blacker, D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., F Demirci, Y., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Ertekin-Taner, N., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Graff-Radford, N. R., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Hamilton-Nelson, K. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Jun, G., Jun, G., M Kamboh, I., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Marson, D. C., Martin, E. R., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., W Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Montine, T. J., Morris, J. C., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Parisi, J. E., Perry, W., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reiman, E. M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Tsuang, D. W., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Rarity of the Alzheimer disease-protective APP A673T variant in the United States.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 2, pp. 209-16, 2015.

Sterol Regulatory Element Binding Protein 1

C. A. Reynolds, Hong, M. - G., Eriksson, U. K., Blennow, K., Wiklund, F., Johansson, B., Malmberg, B., Berg, S., Alexeyenko, A., Grönberg, H., Gatz, M., Pedersen, N. L., and Prince, J. A., “Analysis of lipid pathway genes indicates association of sequence variation near SREBF1/TOM1L2/ATPAF2 with dementia risk.”, Hum Mol Genet, vol. 19, no. 10, pp. 2068-78, 2010.

Statistics as Topic

H. Zhu, Gopalraj, R. K., Kelly, J. F., Bennett, D. A., and Estus, S., “Lack of genetic association of cholesteryl ester transfer protein polymorphisms with late onset Alzheimers disease.”, Neurosci Lett, vol. 381, no. 1-2, pp. 36-41, 2005.

Software

P. - T. Xu, Li, Y. - J., Qin, X. - J., Scherzer, C. R., Xu, H., Schmechel, D. E., Hulette, C. M., Ervin, J., Gullans, S. R., Haines, J., Pericak-Vance, M. A., and Gilbert, J. R., “Differences in apolipoprotein E3/3 and E4/4 allele-specific gene expression in hippocampus in Alzheimer disease.”, Neurobiol Dis, vol. 21, no. 2, pp. 256-75, 2006.

Smoking

J. Mez, Chung, J., Jun, G., Kriegel, J., Bourlas, A. P., Sherva, R., Logue, M. W., Barnes, L. L., Bennett, D. A., Buxbaum, J. D., Byrd, G. S., Crane, P. K., Ertekin-Taner, N., Evans, D., M Fallin, D., Foroud, T., Goate, A., Graff-Radford, N. R., Hall, K. S., M Kamboh, I., Kukull, W. A., Larson, E. B., Manly, J. J., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G. D., Lunetta, K. L., and Farrer, L. A., “Two novel loci, COBL and SLC10A2, for Alzheimer's disease in African Americans.”, Alzheimers Dement, vol. 13, no. 2, pp. 119-129, 2017.