Biblio

A

M. Ghani, Reitz, C., Cheng, R., Vardarajan, B. Narayan, Jun, G., Sato, C., Naj, A., Rajbhandary, R., San Wang, L. -, Valladares, O., Lin, C. - F., Larson, E. B., Graff-Radford, N. R., Evans, D., De Jager, P. L., Crane, P. K., Buxbaum, J. D., Murrell, J. R., Raj, T., Ertekin-Taner, N., Logue, M., Baldwin, C. T., Green, R. C., Barnes, L. L., Cantwell, L. B., M Fallin, D., Go, R. C. P., Griffith, P. A., Obisesan, T. O., Manly, J. J., Lunetta, K. L., M Kamboh, I., Lopez, O. L., Bennett, D. A., Hendrie, H., Hall, K. S., Goate, A. M., Byrd, G. S., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Lee, J. H., Schellenberg, G. D., St George-Hyslop, P., Mayeux, R., and Rogaeva, E., “Association of Long Runs of Homozygosity With Alzheimer Disease Among African American Individuals.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 11, pp. 1313-23, 2015.

C

A. C. Naj, Jun, G., Beecham, G. W., San Wang, L. -, Vardarajan, B. Narayan, Buros, J., Gallins, P. J., Buxbaum, J. D., Jarvik, G. P., Crane, P. K., Larson, E. B., Bird, T. D., Boeve, B. F., Graff-Radford, N. R., De Jager, P. L., Evans, D., Schneider, J. A., Carrasquillo, M. M., Ertekin-Taner, N., Younkin, S. G., Cruchaga, C., Kauwe, J. S. K., Nowotny, P., Kramer, P., Hardy, J., Huentelman, M. J., Myers, A. J., Barmada, M. M., F Demirci, Y., Baldwin, C. T., Green, R. C., Rogaeva, E., St George-Hyslop, P., Arnold, S. E., Barber, R., Beach, T., Bigio, E. H., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Cairns, N. J., Carlson, C. S., Carney, R. M., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Corneveaux, J., Cotman, C. W., Cummings, J. L., DeCarli, C., DeKosky, S. T., Diaz-Arrastia, R., Dick, M., Dickson, D. W., Ellis, W. G., Faber, K. M., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Gilman, S., Giordani, B., Glass, J. D., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Johnson, N., Karlawish, J., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Lah, J. J., Levey, A. I., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Mack, W. J., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Parisi, J. E., Perl, D. P., Peskind, E., Petersen, R. C., Poon, W. W., Quinn, J. F., Rajbhandary, R. A., Raskind, M., Reisberg, B., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosenberg, R. N., Sano, M., Schneider, L. S., Seeley, W., Shelanski, M. L., Slifer, M. A., Smith, C. D., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Woltjer, R. L., Cantwell, L. B., Dombroski, B. A., Beekly, D., Lunetta, K. L., Martin, E. R., M Kamboh, I., Saykin, A. J., Reiman, E. M., Bennett, D. A., Morris, J. C., Montine, T. J., Goate, A. M., Blacker, D., Tsuang, D. W., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Farrer, L. A., and Schellenberg, G. D., “Common variants at MS4A4/MS4A6E, CD2AP, CD33 and EPHA1 are associated with late-onset Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 43, no. 5, pp. 436-41, 2011.

Y. Yee Leung, Ryvkin, P., Ungar, L. H., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “CoRAL: predicting non-coding RNAs from small RNA-sequencing data.”, Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 14, p. e137, 2013.

G

E. E. Blue, Bis, J. C., Dorschner, M. O., Tsuang, D. W., Barral, S. M., Beecham, G., Below, J. E., Bush, W. S., Butkiewicz, M., Cruchaga, C., DeStefano, A., Farrer, L. A., Goate, A., Haines, J., Jaworski, J., Jun, G., Kunkle, B., Kuzma, A., Lee, J. J., Lunetta, K. L., Ma, Y., Martin, E., Naj, A., Nato, A. Q., Navas, P., Nguyen, H., Reitz, C., Reyes, D., Salerno, W., Schellenberg, G. D., Seshadri, S., Sohi, H., Thornton, T. A., Valadares, O., van Duijn, C., Vardarajan, B. N., San Wang, L. -, Boerwinkle, E., Dupuis, J., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., and Wijsman, E. M., “Genetic Variation in Genes Underlying Diverse Dementias May Explain a Small Proportion of Cases in the Alzheimer's Disease Sequencing Project.”, Dement Geriatr Cogn Disord, vol. 45, no. 1-2, pp. 1-17, 2018.

H

Y. - C. Hwang, Zheng, Q., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “High-throughput identification of long-range regulatory elements and their target promoters in the human genome.”, Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 9, pp. 4835-46, 2013.

I

G. U. Höglinger, Melhem, N. M., Dickson, D. W., Sleiman, P. M. A., San Wang, L. -, Klei, L., Rademakers, R., de Silva, R., Litvan, I., Riley, D. E., van Swieten, J. C., Heutink, P., Wszolek, Z. K., Uitti, R. J., Vandrovcova, J., Hurtig, H. I., Gross, R. G., Maetzler, W., Goldwurm, S., Tolosa, E., Borroni, B., Pastor, P., Cantwell, L. B., Han, M. Ryung, Dillman, A., van der Brug, M. P., J Gibbs, R., Cookson, M. R., Hernandez, D. G., Singleton, A. B., Farrer, M. J., Yu, C. - E., Golbe, L. I., Revesz, T., Hardy, J., Lees, A. J., Devlin, B., Hakonarson, H., Müller, U., and Schellenberg, G. D., “Identification of common variants influencing risk of the tauopathy progressive supranuclear palsy.”, Nat Genet, vol. 43, no. 7, pp. 699-705, 2011.

P

S. Mirarab, Nguyen, N., Guo, S., San Wang, L. -, Kim, J., and Warnow, T., “PASTA: Ultra-Large Multiple Sequence Alignment for Nucleotide and Amino-Acid Sequences.”, J Comput Biol, vol. 22, no. 5, pp. 377-86, 2015.

R

R. Sims, van der Lee, S. J., Naj, A. C., Bellenguez, C., Badarinarayan, N., Jakobsdottir, J., Kunkle, B. W., Boland, A., Raybould, R., Bis, J. C., Martin, E. R., Grenier-Boley, B., Heilmann-Heimbach, S., Chouraki, V., Kuzma, A. B., Sleegers, K., Vronskaya, M., Ruiz, A., Graham, R. R., Olaso, R., Hoffmann, P., Grove, M. L., Vardarajan, B. N., Hiltunen, M., Nöthen, M. M., White, C. C., Hamilton-Nelson, K. L., Epelbaum, J., Maier, W., Choi, S. - H., Beecham, G. W., Dulary, C., Herms, S., Smith, A. V., Funk, C. C., Derbois, C., Forstner, A. J., Ahmad, S., Li, H., Bacq, D., Harold, D., Satizabal, C. L., Valladares, O., Squassina, A., Thomas, R., Brody, J. A., Qu, L., Sánchez-Juan, P., Morgan, T., Wolters, F. J., Zhao, Y., Garcia, F. Sanchez, Denning, N., Fornage, M., Malamon, J., Naranjo, M. Candida De, Majounie, E., Mosley, T. H., Dombroski, B., Wallon, D., Lupton, M. K., Dupuis, J., Whitehead, P., Fratiglioni, L., Medway, C., Jian, X., Mukherjee, S., Keller, L., Brown, K., Lin, H., Cantwell, L. B., Panza, F., McGuinness, B., Moreno-Grau, S., Burgess, J. D., Solfrizzi, V., Proitsi, P., Adams, H. H., Allen, M., Seripa, D., Pastor, P., L Cupples, A., Price, N. D., Hannequin, D., Frank-Garcia, A., Levy, D., Chakrabarty, P., Caffarra, P., Giegling, I., Beiser, A. S., Giedraitis, V., Hampel, H., Garcia, M. E., Wang, X., Lannfelt, L., Mecocci, P., Eiriksdottir, G., Crane, P. K., Pasquier, F., Boccardi, V., Henández, I., Barber, R. C., Scherer, M., Tarraga, L., Adams, P. M., Leber, M., Chen, Y., Albert, M. S., Riedel-Heller, S., Emilsson, V., Beekly, D., Braae, A., Schmidt, R., Blacker, D., Masullo, C., Schmidt, H., Doody, R. S., Spalletta, G., Longstreth, W. T., Fairchild, T. J., Bossù, P., Lopez, O. L., Frosch, M. P., Sacchinelli, E., Ghetti, B., Yang, Q., Huebinger, R. M., Jessen, F., Li, S., M Kamboh, I., Morris, J., Sotolongo-Grau, O., Katz, M. J., Corcoran, C., Dunstan, M., Braddel, A., Thomas, C., Meggy, A., Marshall, R., Gerrish, A., Chapman, J., Aguilar, M., Taylor, S., Hill, M., Fairén, M. Díez, Hodges, A., Vellas, B., Soininen, H., Kloszewska, I., Daniilidou, M., Uphill, J., Patel, Y., Hughes, J. T., Lord, J., Turton, J., Hartmann, A. M., Cecchetti, R., Fenoglio, C., Serpente, M., Arcaro, M., Caltagirone, C., Orfei, M. Donata, Ciaramella, A., Pichler, S., Mayhaus, M., Gu, W., Lleó, A., Fortea, J., Blesa, R., Barber, I. S., Brookes, K., Cupidi, C., Maletta, R. Giovanni, Carrell, D., Sorbi, S., Moebus, S., Urbano, M., Pilotto, A., Kornhuber, J., Bosco, P., Todd, S., Craig, D., Johnston, J., Gill, M., Lawlor, B., Lynch, A., Fox, N. C., Hardy, J., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Asthana, S., Atwood, C. S., Baldwin, C. T., Barnes, L. L., Barral, S., Beach, T. G., Becker, J. T., Bigio, E. H., Bird, T. D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Burns, J. M., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carlsson, C. M., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Diaz, C. Ceballos, Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., Dick, M., Duara, R., Evans, D. A., Faber, K. M., Fallon, K. B., Fardo, D. W., Farlow, M. R., Ferris, S., Foroud, T. M., Galasko, D. R., Gearing, M., Geschwind, D. H., Gilbert, J. R., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Honig, L. S., Huentelman, M. J., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Abner, E., Jin, L. - W., Jun, G., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Morris, J. C., Murrell, J. R., Myers, A. J., O'Bryant, S., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Perry, W., Peskind, E., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rogaeva, E., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sager, M. A., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Swerdlow, R. H., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Wilhelmsen, K. C., Williamson, J., Wingo, T. S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Yu, C. - E., Yu, L., Garzia, F., Golamaully, F., Septier, G., Engelborghs, S., Vandenberghe, R., De Deyn, P. P., Fernadez, C. Muñoz, Benito, Y. Aladro, Thonberg, H., Forsell, C., Lilius, L., Kinhult-Stählbom, A., Kilander, L., Brundin, R. M., Concari, L., Helisalmi, S., Koivisto, A. Maria, Haapasalo, A., Dermecourt, V., Fievet, N., Hanon, O., Dufouil, C., Brice, A., Ritchie, K., Dubois, B., Himali, J. J., C Keene, D., Tschanz, J. A., Fitzpatrick, A. L., Kukull, W. A., Norton, M., Aspelund, T., Larson, E. B., Munger, R., Rotter, J. I., Lipton, R. B., Bullido, M. J., Hofman, A., Montine, T. J., Coto, E., Boerwinkle, E., Petersen, R. C., Alvarez, V., Rivadeneira, F., Reiman, E. M., Gallo, M., O'Donnell, C. J., Reisch, J. S., Bruni, A. Cecilia, Royall, D. R., Dichgans, M., Sano, M., Galimberti, D., St George-Hyslop, P., Scarpini, E., Tsuang, D. W., Mancuso, M., Bonuccelli, U., Winslow, A. R., Daniele, A., Wu, C. - K., Peters, O., Nacmias, B., Riemenschneider, M., Heun, R., Brayne, C., Rubinsztein, D. C., Brás, J., Guerreiro, R., Al-Chalabi, A., Shaw, C. E., Collinge, J., Mann, D., Tsolaki, M., Clarimón, J., Sussams, R., Lovestone, S., O'Donovan, M. C., Owen, M. J., Behrens, T. W., Mead, S., Goate, A. M., Uitterlinden, A. G., Holmes, C., Cruchaga, C., Ingelsson, M., Bennett, D. A., Powell, J., Golde, T. E., Graff, C., De Jager, P. L., Morgan, K., Ertekin-Taner, N., Combarros, O., Psaty, B. M., Passmore, P., Younkin, S. G., Berr, C., Gudnason, V., Rujescu, D., Dickson, D. W., Dartigues, J. - F., DeStefano, A. L., Ortega-Cubero, S., Hakonarson, H., Campion, D., Boada, M., Kauwe, J. Keoni, Farrer, L. A., Van Broeckhoven, C., M Ikram, A., Jones, L., Haines, J. L., Tzourio, C., Launer, L. J., Escott-Price, V., Mayeux, R., Deleuze, J. - F., Amin, N., Holmans, P. A., Pericak-Vance, M. A., Amouyel, P., van Duijn, C. M., Ramirez, A., San Wang, L. -, Lambert, J. - C., Seshadri, S., Williams, J., and Schellenberg, G. D., “Rare coding variants in PLCG2, ABI3, and TREM2 implicate microglial-mediated innate immunity in Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 49, no. 9, pp. 1373-1384, 2017.

L. - San Wang, Naj, A. C., Graham, R. R., Crane, P. K., Kunkle, B. W., Cruchaga, C., Murcia, J. D. Gonzalez, Cannon-Albright, L., Baldwin, C. T., Zetterberg, H., Blennow, K., Kukull, W. A., Faber, K. M., Schupf, N., Norton, M. C., Tschanz, J. A. T., Munger, R. G., Corcoran, C. D., Rogaeva, E., Lin, C. - F., Dombroski, B. A., Cantwell, L. B., Partch, A., Valladares, O., Hakonarson, H., St George-Hyslop, P., Green, R. C., Goate, A. M., Foroud, T. M., Carney, R. M., Larson, E. B., Behrens, T. W., Kauwe, J. S. K., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Schellenberg, G. D., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barmada, M., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beecham, G. W., Beekly, D., Bennett, D. A., Bigio, E. H., Bird, T. D., Blacker, D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., F Demirci, Y., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Ertekin-Taner, N., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Graff-Radford, N. R., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Hamilton-Nelson, K. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Jun, G., Jun, G., M Kamboh, I., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Marson, D. C., Martin, E. R., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., W Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Montine, T. J., Morris, J. C., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Parisi, J. E., Perry, W., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reiman, E. M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Tsuang, D. W., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Rarity of the Alzheimer disease-protective APP A673T variant in the United States.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 2, pp. 209-16, 2015.

T

A. Amlie-Wolf, Ryvkin, P., Tong, R., Dragomir, I., Suh, E. R., Xu, Y., Van Deerlin, V. M., Gregory, B. D., Kwong, L. K., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. - Y., San Wang, L. -, and Lee, E. B., “Transcriptomic Changes Due to Cytoplasmic TDP-43 Expression Reveal Dysregulation of Histone Transcripts and Nuclear Chromatin.”, PLoS One, vol. 10, no. 10, p. e0141836, 2015.

V

C. Reitz, Jun, G., Naj, A., Rajbhandary, R., Vardarajan, B. Narayan, San Wang, L. -, Valladares, O., Lin, C. - F., Larson, E. B., Graff-Radford, N. R., Evans, D., De Jager, P. L., Crane, P. K., Buxbaum, J. D., Murrell, J. R., Raj, T., Ertekin-Taner, N., Logue, M., Baldwin, C. T., Green, R. C., Barnes, L. L., Cantwell, L. B., M Fallin, D., Go, R. C. P., Griffith, P., Obisesan, T. O., Manly, J. J., Lunetta, K. L., M Kamboh, I., Lopez, O. L., Bennett, D. A., Hendrie, H., Hall, K. S., Goate, A. M., Byrd, G. S., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G. D., and Mayeux, R., “Variants in the ATP-binding cassette transporter (ABCA7), apolipoprotein E ϵ4,and the risk of late-onset Alzheimer disease in African Americans.”, JAMA, vol. 309, no. 14, pp. 1483-92, 2013.