Biblio
Found 245 results
Author [ Keyword![(Desc)](https://www.niagads.org/sites/all/modules/contrib/biblio/misc/arrow-desc.png)
Filters: Author is Wang, Li-San [Clear All Filters]
Promoter Regions, Genetic
Y. - C. Hwang, Lin, C. - F., Valladares, O., Malamon, J., Kuksa, P. P., Zheng, Q., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HIPPIE: a high-throughput identification pipeline for promoter interacting enhancer elements.”, Bioinformatics, vol. 31, no. 8, pp. 1290-2, 2015.
Y. - C. Hwang, Zheng, Q., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “High-throughput identification of long-range regulatory elements and their target promoters in the human genome.”, Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 9, pp. 4835-46, 2013.
Prospective Studies
A. C. Naj, Jun, G., Reitz, C., Kunkle, B. W., Perry, W., Park, Y. Son, Beecham, G. W., Rajbhandary, R. A., Hamilton-Nelson, K. L., San Wang, L. -, Kauwe, J. S. K., Huentelman, M. J., Myers, A. J., Bird, T. D., Boeve, B. F., Baldwin, C. T., Jarvik, G. P., Crane, P. K., Rogaeva, E., M Barmada, M., F Demirci, Y., Cruchaga, C., Kramer, P. L., Ertekin-Taner, N., Hardy, J., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Larson, E. B., St George-Hyslop, P. H., Buxbaum, J. D., Evans, D. A., Schneider, J. A., Lunetta, K. L., M Kamboh, I., Saykin, A. J., Reiman, E. M., De Jager, P. L., Bennett, D. A., Morris, J. C., Montine, T. J., Goate, A. M., Blacker, D., Tsuang, D. W., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Martin, E. R., Haines, J. L., Mayeux, R. P., Farrer, L. A., Schellenberg, G. D., Pericak-Vance, M. A., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beekly, D., Bigio, E. H., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Cairns, N. J., Cantwell, L. B., Cao, C., Carlson, C. S., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Corneveaux, J., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Faber, K. M., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lin, C. - F., Lopez, O. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Valladares, O., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Effects of multiple genetic loci on age at onset in late-onset Alzheimer disease: a genome-wide association study.”, JAMA Neurol, vol. 71, no. 11, pp. 1394-404, 2014.
Protective Factors
L. - San Wang, Naj, A. C., Graham, R. R., Crane, P. K., Kunkle, B. W., Cruchaga, C., Murcia, J. D. Gonzalez, Cannon-Albright, L., Baldwin, C. T., Zetterberg, H., Blennow, K., Kukull, W. A., Faber, K. M., Schupf, N., Norton, M. C., Tschanz, J. A. T., Munger, R. G., Corcoran, C. D., Rogaeva, E., Lin, C. - F., Dombroski, B. A., Cantwell, L. B., Partch, A., Valladares, O., Hakonarson, H., St George-Hyslop, P., Green, R. C., Goate, A. M., Foroud, T. M., Carney, R. M., Larson, E. B., Behrens, T. W., Kauwe, J. S. K., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Schellenberg, G. D., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barmada, M., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beecham, G. W., Beekly, D., Bennett, D. A., Bigio, E. H., Bird, T. D., Blacker, D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., F Demirci, Y., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Ertekin-Taner, N., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Graff-Radford, N. R., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Hamilton-Nelson, K. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Jun, G., Jun, G., M Kamboh, I., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Marson, D. C., Martin, E. R., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., W Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Montine, T. J., Morris, J. C., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Parisi, J. E., Perry, W., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reiman, E. M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Tsuang, D. W., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Rarity of the Alzheimer disease-protective APP A673T variant in the United States.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 2, pp. 209-16, 2015.
Protein Interaction Maps
R. Sims, van der Lee, S. J., Naj, A. C., Bellenguez, C., Badarinarayan, N., Jakobsdottir, J., Kunkle, B. W., Boland, A., Raybould, R., Bis, J. C., Martin, E. R., Grenier-Boley, B., Heilmann-Heimbach, S., Chouraki, V., Kuzma, A. B., Sleegers, K., Vronskaya, M., Ruiz, A., Graham, R. R., Olaso, R., Hoffmann, P., Grove, M. L., Vardarajan, B. N., Hiltunen, M., Nöthen, M. M., White, C. C., Hamilton-Nelson, K. L., Epelbaum, J., Maier, W., Choi, S. - H., Beecham, G. W., Dulary, C., Herms, S., Smith, A. V., Funk, C. C., Derbois, C., Forstner, A. J., Ahmad, S., Li, H., Bacq, D., Harold, D., Satizabal, C. L., Valladares, O., Squassina, A., Thomas, R., Brody, J. A., Qu, L., Sánchez-Juan, P., Morgan, T., Wolters, F. J., Zhao, Y., Garcia, F. Sanchez, Denning, N., Fornage, M., Malamon, J., Naranjo, M. Candida De, Majounie, E., Mosley, T. H., Dombroski, B., Wallon, D., Lupton, M. K., Dupuis, J., Whitehead, P., Fratiglioni, L., Medway, C., Jian, X., Mukherjee, S., Keller, L., Brown, K., Lin, H., Cantwell, L. B., Panza, F., McGuinness, B., Moreno-Grau, S., Burgess, J. D., Solfrizzi, V., Proitsi, P., Adams, H. H., Allen, M., Seripa, D., Pastor, P., L Cupples, A., Price, N. D., Hannequin, D., Frank-Garcia, A., Levy, D., Chakrabarty, P., Caffarra, P., Giegling, I., Beiser, A. S., Giedraitis, V., Hampel, H., Garcia, M. E., Wang, X., Lannfelt, L., Mecocci, P., Eiriksdottir, G., Crane, P. K., Pasquier, F., Boccardi, V., Henández, I., Barber, R. C., Scherer, M., Tarraga, L., Adams, P. M., Leber, M., Chen, Y., Albert, M. S., Riedel-Heller, S., Emilsson, V., Beekly, D., Braae, A., Schmidt, R., Blacker, D., Masullo, C., Schmidt, H., Doody, R. S., Spalletta, G., Longstreth, W. T., Fairchild, T. J., Bossù, P., Lopez, O. L., Frosch, M. P., Sacchinelli, E., Ghetti, B., Yang, Q., Huebinger, R. M., Jessen, F., Li, S., M Kamboh, I., Morris, J., Sotolongo-Grau, O., Katz, M. J., Corcoran, C., Dunstan, M., Braddel, A., Thomas, C., Meggy, A., Marshall, R., Gerrish, A., Chapman, J., Aguilar, M., Taylor, S., Hill, M., Fairén, M. Díez, Hodges, A., Vellas, B., Soininen, H., Kloszewska, I., Daniilidou, M., Uphill, J., Patel, Y., Hughes, J. T., Lord, J., Turton, J., Hartmann, A. M., Cecchetti, R., Fenoglio, C., Serpente, M., Arcaro, M., Caltagirone, C., Orfei, M. Donata, Ciaramella, A., Pichler, S., Mayhaus, M., Gu, W., Lleó, A., Fortea, J., Blesa, R., Barber, I. S., Brookes, K., Cupidi, C., Maletta, R. Giovanni, Carrell, D., Sorbi, S., Moebus, S., Urbano, M., Pilotto, A., Kornhuber, J., Bosco, P., Todd, S., Craig, D., Johnston, J., Gill, M., Lawlor, B., Lynch, A., Fox, N. C., Hardy, J., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Asthana, S., Atwood, C. S., Baldwin, C. T., Barnes, L. L., Barral, S., Beach, T. G., Becker, J. T., Bigio, E. H., Bird, T. D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Burns, J. M., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carlsson, C. M., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Diaz, C. Ceballos, Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., Dick, M., Duara, R., Evans, D. A., Faber, K. M., Fallon, K. B., Fardo, D. W., Farlow, M. R., Ferris, S., Foroud, T. M., Galasko, D. R., Gearing, M., Geschwind, D. H., Gilbert, J. R., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Honig, L. S., Huentelman, M. J., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Abner, E., Jin, L. - W., Jun, G., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Morris, J. C., Murrell, J. R., Myers, A. J., O'Bryant, S., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Perry, W., Peskind, E., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rogaeva, E., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sager, M. A., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Swerdlow, R. H., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Wilhelmsen, K. C., Williamson, J., Wingo, T. S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Yu, C. - E., Yu, L., Garzia, F., Golamaully, F., Septier, G., Engelborghs, S., Vandenberghe, R., De Deyn, P. P., Fernadez, C. Muñoz, Benito, Y. Aladro, Thonberg, H., Forsell, C., Lilius, L., Kinhult-Stählbom, A., Kilander, L., Brundin, R. M., Concari, L., Helisalmi, S., Koivisto, A. Maria, Haapasalo, A., Dermecourt, V., Fievet, N., Hanon, O., Dufouil, C., Brice, A., Ritchie, K., Dubois, B., Himali, J. J., C Keene, D., Tschanz, J. A., Fitzpatrick, A. L., Kukull, W. A., Norton, M., Aspelund, T., Larson, E. B., Munger, R., Rotter, J. I., Lipton, R. B., Bullido, M. J., Hofman, A., Montine, T. J., Coto, E., Boerwinkle, E., Petersen, R. C., Alvarez, V., Rivadeneira, F., Reiman, E. M., Gallo, M., O'Donnell, C. J., Reisch, J. S., Bruni, A. Cecilia, Royall, D. R., Dichgans, M., Sano, M., Galimberti, D., St George-Hyslop, P., Scarpini, E., Tsuang, D. W., Mancuso, M., Bonuccelli, U., Winslow, A. R., Daniele, A., Wu, C. - K., Peters, O., Nacmias, B., Riemenschneider, M., Heun, R., Brayne, C., Rubinsztein, D. C., Brás, J., Guerreiro, R., Al-Chalabi, A., Shaw, C. E., Collinge, J., Mann, D., Tsolaki, M., Clarimón, J., Sussams, R., Lovestone, S., O'Donovan, M. C., Owen, M. J., Behrens, T. W., Mead, S., Goate, A. M., Uitterlinden, A. G., Holmes, C., Cruchaga, C., Ingelsson, M., Bennett, D. A., Powell, J., Golde, T. E., Graff, C., De Jager, P. L., Morgan, K., Ertekin-Taner, N., Combarros, O., Psaty, B. M., Passmore, P., Younkin, S. G., Berr, C., Gudnason, V., Rujescu, D., Dickson, D. W., Dartigues, J. - F., DeStefano, A. L., Ortega-Cubero, S., Hakonarson, H., Campion, D., Boada, M., Kauwe, J. Keoni, Farrer, L. A., Van Broeckhoven, C., M Ikram, A., Jones, L., Haines, J. L., Tzourio, C., Launer, L. J., Escott-Price, V., Mayeux, R., Deleuze, J. - F., Amin, N., Holmans, P. A., Pericak-Vance, M. A., Amouyel, P., van Duijn, C. M., Ramirez, A., San Wang, L. -, Lambert, J. - C., Seshadri, S., Williams, J., and Schellenberg, G. D., “Rare coding variants in PLCG2, ABI3, and TREM2 implicate microglial-mediated innate immunity in Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 49, no. 9, pp. 1373-1384, 2017.
Receptor, EphA1
A. C. Naj, Jun, G., Beecham, G. W., San Wang, L. -, Vardarajan, B. Narayan, Buros, J., Gallins, P. J., Buxbaum, J. D., Jarvik, G. P., Crane, P. K., Larson, E. B., Bird, T. D., Boeve, B. F., Graff-Radford, N. R., De Jager, P. L., Evans, D., Schneider, J. A., Carrasquillo, M. M., Ertekin-Taner, N., Younkin, S. G., Cruchaga, C., Kauwe, J. S. K., Nowotny, P., Kramer, P., Hardy, J., Huentelman, M. J., Myers, A. J., Barmada, M. M., F Demirci, Y., Baldwin, C. T., Green, R. C., Rogaeva, E., St George-Hyslop, P., Arnold, S. E., Barber, R., Beach, T., Bigio, E. H., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Cairns, N. J., Carlson, C. S., Carney, R. M., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Corneveaux, J., Cotman, C. W., Cummings, J. L., DeCarli, C., DeKosky, S. T., Diaz-Arrastia, R., Dick, M., Dickson, D. W., Ellis, W. G., Faber, K. M., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Gilman, S., Giordani, B., Glass, J. D., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Johnson, N., Karlawish, J., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Lah, J. J., Levey, A. I., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Mack, W. J., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Parisi, J. E., Perl, D. P., Peskind, E., Petersen, R. C., Poon, W. W., Quinn, J. F., Rajbhandary, R. A., Raskind, M., Reisberg, B., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosenberg, R. N., Sano, M., Schneider, L. S., Seeley, W., Shelanski, M. L., Slifer, M. A., Smith, C. D., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Woltjer, R. L., Cantwell, L. B., Dombroski, B. A., Beekly, D., Lunetta, K. L., Martin, E. R., M Kamboh, I., Saykin, A. J., Reiman, E. M., Bennett, D. A., Morris, J. C., Montine, T. J., Goate, A. M., Blacker, D., Tsuang, D. W., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Farrer, L. A., and Schellenberg, G. D., “Common variants at MS4A4/MS4A6E, CD2AP, CD33 and EPHA1 are associated with late-onset Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 43, no. 5, pp. 436-41, 2011.
Receptors, GABA
G. R. Jun, Chung, J., Mez, J., Barber, R., Beecham, G. W., Bennett, D. A., Buxbaum, J. D., Byrd, G. S., Carrasquillo, M. M., Crane, P. K., Cruchaga, C., De Jager, P., Ertekin-Taner, N., Evans, D., M Fallin, D., Foroud, T. M., Friedland, R. P., Goate, A. M., Graff-Radford, N. R., Hendrie, H., Hall, K. S., Hamilton-Nelson, K. L., Inzelberg, R., M Kamboh, I., Kauwe, J. S. K., Kukull, W. A., Kunkle, B. W., Kuwano, R., Larson, E. B., Logue, M. W., Manly, J. J., Martin, E. R., Montine, T. J., Mukherjee, S., Naj, A., Reiman, E. M., Reitz, C., Sherva, R., St George-Hyslop, P. H., Thornton, T., Younkin, S. G., Vardarajan, B. N., San Wang, L. -, Wendlund, J. R., Winslow, A. R., Haines, J., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G., Lunetta, K. L., and Farrer, L. A., “Transethnic genome-wide scan identifies novel Alzheimer's disease loci.”, Alzheimers Dement, vol. 13, no. 7, pp. 727-738, 2017.
Receptors, Immunologic
R. Sims, van der Lee, S. J., Naj, A. C., Bellenguez, C., Badarinarayan, N., Jakobsdottir, J., Kunkle, B. W., Boland, A., Raybould, R., Bis, J. C., Martin, E. R., Grenier-Boley, B., Heilmann-Heimbach, S., Chouraki, V., Kuzma, A. B., Sleegers, K., Vronskaya, M., Ruiz, A., Graham, R. R., Olaso, R., Hoffmann, P., Grove, M. L., Vardarajan, B. N., Hiltunen, M., Nöthen, M. M., White, C. C., Hamilton-Nelson, K. L., Epelbaum, J., Maier, W., Choi, S. - H., Beecham, G. W., Dulary, C., Herms, S., Smith, A. V., Funk, C. C., Derbois, C., Forstner, A. J., Ahmad, S., Li, H., Bacq, D., Harold, D., Satizabal, C. L., Valladares, O., Squassina, A., Thomas, R., Brody, J. A., Qu, L., Sánchez-Juan, P., Morgan, T., Wolters, F. J., Zhao, Y., Garcia, F. Sanchez, Denning, N., Fornage, M., Malamon, J., Naranjo, M. Candida De, Majounie, E., Mosley, T. H., Dombroski, B., Wallon, D., Lupton, M. K., Dupuis, J., Whitehead, P., Fratiglioni, L., Medway, C., Jian, X., Mukherjee, S., Keller, L., Brown, K., Lin, H., Cantwell, L. B., Panza, F., McGuinness, B., Moreno-Grau, S., Burgess, J. D., Solfrizzi, V., Proitsi, P., Adams, H. H., Allen, M., Seripa, D., Pastor, P., L Cupples, A., Price, N. D., Hannequin, D., Frank-Garcia, A., Levy, D., Chakrabarty, P., Caffarra, P., Giegling, I., Beiser, A. S., Giedraitis, V., Hampel, H., Garcia, M. E., Wang, X., Lannfelt, L., Mecocci, P., Eiriksdottir, G., Crane, P. K., Pasquier, F., Boccardi, V., Henández, I., Barber, R. C., Scherer, M., Tarraga, L., Adams, P. M., Leber, M., Chen, Y., Albert, M. S., Riedel-Heller, S., Emilsson, V., Beekly, D., Braae, A., Schmidt, R., Blacker, D., Masullo, C., Schmidt, H., Doody, R. S., Spalletta, G., Longstreth, W. T., Fairchild, T. J., Bossù, P., Lopez, O. L., Frosch, M. P., Sacchinelli, E., Ghetti, B., Yang, Q., Huebinger, R. M., Jessen, F., Li, S., M Kamboh, I., Morris, J., Sotolongo-Grau, O., Katz, M. J., Corcoran, C., Dunstan, M., Braddel, A., Thomas, C., Meggy, A., Marshall, R., Gerrish, A., Chapman, J., Aguilar, M., Taylor, S., Hill, M., Fairén, M. Díez, Hodges, A., Vellas, B., Soininen, H., Kloszewska, I., Daniilidou, M., Uphill, J., Patel, Y., Hughes, J. T., Lord, J., Turton, J., Hartmann, A. M., Cecchetti, R., Fenoglio, C., Serpente, M., Arcaro, M., Caltagirone, C., Orfei, M. Donata, Ciaramella, A., Pichler, S., Mayhaus, M., Gu, W., Lleó, A., Fortea, J., Blesa, R., Barber, I. S., Brookes, K., Cupidi, C., Maletta, R. Giovanni, Carrell, D., Sorbi, S., Moebus, S., Urbano, M., Pilotto, A., Kornhuber, J., Bosco, P., Todd, S., Craig, D., Johnston, J., Gill, M., Lawlor, B., Lynch, A., Fox, N. C., Hardy, J., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Asthana, S., Atwood, C. S., Baldwin, C. T., Barnes, L. L., Barral, S., Beach, T. G., Becker, J. T., Bigio, E. H., Bird, T. D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Burns, J. M., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carlsson, C. M., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Diaz, C. Ceballos, Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., Dick, M., Duara, R., Evans, D. A., Faber, K. M., Fallon, K. B., Fardo, D. W., Farlow, M. R., Ferris, S., Foroud, T. M., Galasko, D. R., Gearing, M., Geschwind, D. H., Gilbert, J. R., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Honig, L. S., Huentelman, M. J., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Abner, E., Jin, L. - W., Jun, G., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Morris, J. C., Murrell, J. R., Myers, A. J., O'Bryant, S., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Perry, W., Peskind, E., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rogaeva, E., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sager, M. A., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Swerdlow, R. H., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Wilhelmsen, K. C., Williamson, J., Wingo, T. S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Yu, C. - E., Yu, L., Garzia, F., Golamaully, F., Septier, G., Engelborghs, S., Vandenberghe, R., De Deyn, P. P., Fernadez, C. Muñoz, Benito, Y. Aladro, Thonberg, H., Forsell, C., Lilius, L., Kinhult-Stählbom, A., Kilander, L., Brundin, R. M., Concari, L., Helisalmi, S., Koivisto, A. Maria, Haapasalo, A., Dermecourt, V., Fievet, N., Hanon, O., Dufouil, C., Brice, A., Ritchie, K., Dubois, B., Himali, J. J., C Keene, D., Tschanz, J. A., Fitzpatrick, A. L., Kukull, W. A., Norton, M., Aspelund, T., Larson, E. B., Munger, R., Rotter, J. I., Lipton, R. B., Bullido, M. J., Hofman, A., Montine, T. J., Coto, E., Boerwinkle, E., Petersen, R. C., Alvarez, V., Rivadeneira, F., Reiman, E. M., Gallo, M., O'Donnell, C. J., Reisch, J. S., Bruni, A. Cecilia, Royall, D. R., Dichgans, M., Sano, M., Galimberti, D., St George-Hyslop, P., Scarpini, E., Tsuang, D. W., Mancuso, M., Bonuccelli, U., Winslow, A. R., Daniele, A., Wu, C. - K., Peters, O., Nacmias, B., Riemenschneider, M., Heun, R., Brayne, C., Rubinsztein, D. C., Brás, J., Guerreiro, R., Al-Chalabi, A., Shaw, C. E., Collinge, J., Mann, D., Tsolaki, M., Clarimón, J., Sussams, R., Lovestone, S., O'Donovan, M. C., Owen, M. J., Behrens, T. W., Mead, S., Goate, A. M., Uitterlinden, A. G., Holmes, C., Cruchaga, C., Ingelsson, M., Bennett, D. A., Powell, J., Golde, T. E., Graff, C., De Jager, P. L., Morgan, K., Ertekin-Taner, N., Combarros, O., Psaty, B. M., Passmore, P., Younkin, S. G., Berr, C., Gudnason, V., Rujescu, D., Dickson, D. W., Dartigues, J. - F., DeStefano, A. L., Ortega-Cubero, S., Hakonarson, H., Campion, D., Boada, M., Kauwe, J. Keoni, Farrer, L. A., Van Broeckhoven, C., M Ikram, A., Jones, L., Haines, J. L., Tzourio, C., Launer, L. J., Escott-Price, V., Mayeux, R., Deleuze, J. - F., Amin, N., Holmans, P. A., Pericak-Vance, M. A., Amouyel, P., van Duijn, C. M., Ramirez, A., San Wang, L. -, Lambert, J. - C., Seshadri, S., Williams, J., and Schellenberg, G. D., “Rare coding variants in PLCG2, ABI3, and TREM2 implicate microglial-mediated innate immunity in Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 49, no. 9, pp. 1373-1384, 2017.
Reproducibility of Results
A. Amlie-Wolf, Ryvkin, P., Tong, R., Dragomir, I., Suh, E. R., Xu, Y., Van Deerlin, V. M., Gregory, B. D., Kwong, L. K., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. - Y., San Wang, L. -, and Lee, E. B., “Transcriptomic Changes Due to Cytoplasmic TDP-43 Expression Reveal Dysregulation of Histone Transcripts and Nuclear Chromatin.”, PLoS One, vol. 10, no. 10, p. e0141836, 2015.
Risk
C. Reitz, Jun, G., Naj, A., Rajbhandary, R., Vardarajan, B. Narayan, San Wang, L. -, Valladares, O., Lin, C. - F., Larson, E. B., Graff-Radford, N. R., Evans, D., De Jager, P. L., Crane, P. K., Buxbaum, J. D., Murrell, J. R., Raj, T., Ertekin-Taner, N., Logue, M., Baldwin, C. T., Green, R. C., Barnes, L. L., Cantwell, L. B., M Fallin, D., Go, R. C. P., Griffith, P., Obisesan, T. O., Manly, J. J., Lunetta, K. L., M Kamboh, I., Lopez, O. L., Bennett, D. A., Hendrie, H., Hall, K. S., Goate, A. M., Byrd, G. S., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G. D., and Mayeux, R., “Variants in the ATP-binding cassette transporter (ABCA7), apolipoprotein E ϵ4,and the risk of late-onset Alzheimer disease in African Americans.”, JAMA, vol. 309, no. 14, pp. 1483-92, 2013.
Risk Factors
G. U. Höglinger, Melhem, N. M., Dickson, D. W., Sleiman, P. M. A., San Wang, L. -, Klei, L., Rademakers, R., de Silva, R., Litvan, I., Riley, D. E., van Swieten, J. C., Heutink, P., Wszolek, Z. K., Uitti, R. J., Vandrovcova, J., Hurtig, H. I., Gross, R. G., Maetzler, W., Goldwurm, S., Tolosa, E., Borroni, B., Pastor, P., Cantwell, L. B., Han, M. Ryung, Dillman, A., van der Brug, M. P., J Gibbs, R., Cookson, M. R., Hernandez, D. G., Singleton, A. B., Farrer, M. J., Yu, C. - E., Golbe, L. I., Revesz, T., Hardy, J., Lees, A. J., Devlin, B., Hakonarson, H., Müller, U., and Schellenberg, G. D., “Identification of common variants influencing risk of the tauopathy progressive supranuclear palsy.”, Nat Genet, vol. 43, no. 7, pp. 699-705, 2011.
A. C. Naj, Jun, G., Reitz, C., Kunkle, B. W., Perry, W., Park, Y. Son, Beecham, G. W., Rajbhandary, R. A., Hamilton-Nelson, K. L., San Wang, L. -, Kauwe, J. S. K., Huentelman, M. J., Myers, A. J., Bird, T. D., Boeve, B. F., Baldwin, C. T., Jarvik, G. P., Crane, P. K., Rogaeva, E., M Barmada, M., F Demirci, Y., Cruchaga, C., Kramer, P. L., Ertekin-Taner, N., Hardy, J., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Larson, E. B., St George-Hyslop, P. H., Buxbaum, J. D., Evans, D. A., Schneider, J. A., Lunetta, K. L., M Kamboh, I., Saykin, A. J., Reiman, E. M., De Jager, P. L., Bennett, D. A., Morris, J. C., Montine, T. J., Goate, A. M., Blacker, D., Tsuang, D. W., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Foroud, T. M., Martin, E. R., Haines, J. L., Mayeux, R. P., Farrer, L. A., Schellenberg, G. D., Pericak-Vance, M. A., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beekly, D., Bigio, E. H., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Cairns, N. J., Cantwell, L. B., Cao, C., Carlson, C. S., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Corneveaux, J., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Faber, K. M., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lin, C. - F., Lopez, O. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Valladares, O., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Effects of multiple genetic loci on age at onset in late-onset Alzheimer disease: a genome-wide association study.”, JAMA Neurol, vol. 71, no. 11, pp. 1394-404, 2014.
RNA
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Silverman, I. M., Childress, M., Valladares, O., Dragomir, I., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HAMR: high-throughput annotation of modified ribonucleotides.”, RNA, vol. 19, no. 12, pp. 1684-92, 2013.
RNA Polymerase II
Y. - C. Hwang, Zheng, Q., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “High-throughput identification of long-range regulatory elements and their target promoters in the human genome.”, Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 9, pp. 4835-46, 2013.
RNA Processing, Post-Transcriptional
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Silverman, I. M., Childress, M., Valladares, O., Dragomir, I., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HAMR: high-throughput annotation of modified ribonucleotides.”, RNA, vol. 19, no. 12, pp. 1684-92, 2013.
Y. Yee Leung, Kuksa, P. P., Amlie-Wolf, A., Valladares, O., Ungar, L. H., Kannan, S., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “DASHR: database of small human noncoding RNAs.”, Nucleic Acids Res, vol. 44, no. D1, pp. D216-22, 2016.
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Ungar, L. H., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “Using machine learning and high-throughput RNA sequencing to classify the precursors of small non-coding RNAs.”, Methods, vol. 67, no. 1, pp. 28-35, 2014.
RNA Splicing
A. Amlie-Wolf, Ryvkin, P., Tong, R., Dragomir, I., Suh, E. R., Xu, Y., Van Deerlin, V. M., Gregory, B. D., Kwong, L. K., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. - Y., San Wang, L. -, and Lee, E. B., “Transcriptomic Changes Due to Cytoplasmic TDP-43 Expression Reveal Dysregulation of Histone Transcripts and Nuclear Chromatin.”, PLoS One, vol. 10, no. 10, p. e0141836, 2015.
RNA, Small Untranslated
Y. Yee Leung, Kuksa, P. P., Amlie-Wolf, A., Valladares, O., Ungar, L. H., Kannan, S., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “DASHR: database of small human noncoding RNAs.”, Nucleic Acids Res, vol. 44, no. D1, pp. D216-22, 2016.
Y. Yee Leung, Ryvkin, P., Ungar, L. H., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “CoRAL: predicting non-coding RNAs from small RNA-sequencing data.”, Nucleic Acids Res, vol. 41, no. 14, p. e137, 2013.
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Ungar, L. H., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “Using machine learning and high-throughput RNA sequencing to classify the precursors of small non-coding RNAs.”, Methods, vol. 67, no. 1, pp. 28-35, 2014.
RNA, Transfer
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Silverman, I. M., Childress, M., Valladares, O., Dragomir, I., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HAMR: high-throughput annotation of modified ribonucleotides.”, RNA, vol. 19, no. 12, pp. 1684-92, 2013.
Saccharomyces cerevisiae
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Silverman, I. M., Childress, M., Valladares, O., Dragomir, I., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HAMR: high-throughput annotation of modified ribonucleotides.”, RNA, vol. 19, no. 12, pp. 1684-92, 2013.
Sequence Alignment
P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Silverman, I. M., Childress, M., Valladares, O., Dragomir, I., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “HAMR: high-throughput annotation of modified ribonucleotides.”, RNA, vol. 19, no. 12, pp. 1684-92, 2013.
S. Mirarab, Nguyen, N., Guo, S., San Wang, L. -, Kim, J., and Warnow, T., “PASTA: Ultra-Large Multiple Sequence Alignment for Nucleotide and Amino-Acid Sequences.”, J Comput Biol, vol. 22, no. 5, pp. 377-86, 2015.