Biblio

D. A. Bennett, Schneider, J. A., Buchman, A. S., Barnes, L. L., Boyle, P. A., and Wilson, R. S., “Overview and findings from the rush Memory and Aging Project.”, Curr Alzheimer Res, vol. 9, no. 6, pp. 646-63, 2012.

R. S. Desikan, Schork, A. J., Wang, Y., Thompson, W. K., Dehghan, A., Ridker, P. M., Chasman, D. I., McEvoy, L. K., Holland, D., Chen, C. - H., Karow, D. S., Brewer, J. B., Hess, C. P., Williams, J., Sims, R., O'Donovan, M. C., Choi, S. Hoan, Bis, J. C., M Ikram, A., Gudnason, V., DeStefano, A. L., van der Lee, S. J., Psaty, B. M., van Duijn, C. M., Launer, L., Seshadri, S., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Haines, J. L., Farrer, L. A., Hardy, J., Ulstein, I. Dina, Aarsland, D., Fladby, T., White, L. R., Sando, S. B., Rongve, A., Witoelar, A., Djurovic, S., Hyman, B. T., Snaedal, J., Steinberg, S., Stefansson, H., Stefansson, K., Schellenberg, G. D., Andreassen, O. A., and Dale, A. M., “Polygenic Overlap Between C-Reactive Protein, Plasma Lipids, and Alzheimer Disease.”, Circulation, vol. 131, no. 23, pp. 2061-2069, 2015.

P. M. Erlich, Lunetta, K. L., L Cupples, A., Huyck, M., Green, R. C., Baldwin, C. T., and Farrer, L. A., “Polymorphisms in the PON gene cluster are associated with Alzheimer disease.”, Hum Mol Genet, vol. 15, no. 1, pp. 77-85, 2006.

Y. Deming, Xia, J., Cai, Y., Lord, J., Holmans, P., Bertelsen, S., Holtzman, D., Morris, J. C., Bales, K., Pickering, E. H., Kauwe, J., Goate, A., and Cruchaga, C., “A potential endophenotype for Alzheimer's disease: cerebrospinal fluid clusterin.”, Neurobiol Aging, vol. 37, pp. 208.e1-208.e9, 2016.

R. Sims, van der Lee, S. J., Naj, A. C., Bellenguez, C., Badarinarayan, N., Jakobsdottir, J., Kunkle, B. W., Boland, A., Raybould, R., Bis, J. C., Martin, E. R., Grenier-Boley, B., Heilmann-Heimbach, S., Chouraki, V., Kuzma, A. B., Sleegers, K., Vronskaya, M., Ruiz, A., Graham, R. R., Olaso, R., Hoffmann, P., Grove, M. L., Vardarajan, B. N., Hiltunen, M., Nöthen, M. M., White, C. C., Hamilton-Nelson, K. L., Epelbaum, J., Maier, W., Choi, S. - H., Beecham, G. W., Dulary, C., Herms, S., Smith, A. V., Funk, C. C., Derbois, C., Forstner, A. J., Ahmad, S., Li, H., Bacq, D., Harold, D., Satizabal, C. L., Valladares, O., Squassina, A., Thomas, R., Brody, J. A., Qu, L., Sánchez-Juan, P., Morgan, T., Wolters, F. J., Zhao, Y., Garcia, F. Sanchez, Denning, N., Fornage, M., Malamon, J., Naranjo, M. Candida De, Majounie, E., Mosley, T. H., Dombroski, B., Wallon, D., Lupton, M. K., Dupuis, J., Whitehead, P., Fratiglioni, L., Medway, C., Jian, X., Mukherjee, S., Keller, L., Brown, K., Lin, H., Cantwell, L. B., Panza, F., McGuinness, B., Moreno-Grau, S., Burgess, J. D., Solfrizzi, V., Proitsi, P., Adams, H. H., Allen, M., Seripa, D., Pastor, P., L Cupples, A., Price, N. D., Hannequin, D., Frank-Garcia, A., Levy, D., Chakrabarty, P., Caffarra, P., Giegling, I., Beiser, A. S., Giedraitis, V., Hampel, H., Garcia, M. E., Wang, X., Lannfelt, L., Mecocci, P., Eiriksdottir, G., Crane, P. K., Pasquier, F., Boccardi, V., Henández, I., Barber, R. C., Scherer, M., Tarraga, L., Adams, P. M., Leber, M., Chen, Y., Albert, M. S., Riedel-Heller, S., Emilsson, V., Beekly, D., Braae, A., Schmidt, R., Blacker, D., Masullo, C., Schmidt, H., Doody, R. S., Spalletta, G., Longstreth, W. T., Fairchild, T. J., Bossù, P., Lopez, O. L., Frosch, M. P., Sacchinelli, E., Ghetti, B., Yang, Q., Huebinger, R. M., Jessen, F., Li, S., M Kamboh, I., Morris, J., Sotolongo-Grau, O., Katz, M. J., Corcoran, C., Dunstan, M., Braddel, A., Thomas, C., Meggy, A., Marshall, R., Gerrish, A., Chapman, J., Aguilar, M., Taylor, S., Hill, M., Fairén, M. Díez, Hodges, A., Vellas, B., Soininen, H., Kloszewska, I., Daniilidou, M., Uphill, J., Patel, Y., Hughes, J. T., Lord, J., Turton, J., Hartmann, A. M., Cecchetti, R., Fenoglio, C., Serpente, M., Arcaro, M., Caltagirone, C., Orfei, M. Donata, Ciaramella, A., Pichler, S., Mayhaus, M., Gu, W., Lleó, A., Fortea, J., Blesa, R., Barber, I. S., Brookes, K., Cupidi, C., Maletta, R. Giovanni, Carrell, D., Sorbi, S., Moebus, S., Urbano, M., Pilotto, A., Kornhuber, J., Bosco, P., Todd, S., Craig, D., Johnston, J., Gill, M., Lawlor, B., Lynch, A., Fox, N. C., Hardy, J., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Asthana, S., Atwood, C. S., Baldwin, C. T., Barnes, L. L., Barral, S., Beach, T. G., Becker, J. T., Bigio, E. H., Bird, T. D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Burns, J. M., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carlsson, C. M., Carney, R. M., Carrasquillo, M. M., Carroll, S. L., Diaz, C. Ceballos, Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., Dick, M., Duara, R., Evans, D. A., Faber, K. M., Fallon, K. B., Fardo, D. W., Farlow, M. R., Ferris, S., Foroud, T. M., Galasko, D. R., Gearing, M., Geschwind, D. H., Gilbert, J. R., Graff-Radford, N. R., Green, R. C., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Harrell, L. E., Honig, L. S., Huentelman, M. J., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Abner, E., Jin, L. - W., Jun, G., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Marson, D. C., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Morris, J. C., Murrell, J. R., Myers, A. J., O'Bryant, S., Olichney, J. M., Pankratz, V. S., Parisi, J. E., Paulson, H. L., Perry, W., Peskind, E., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rogaeva, E., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sager, M. A., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Swerdlow, R. H., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Wilhelmsen, K. C., Williamson, J., Wingo, T. S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Yu, C. - E., Yu, L., Garzia, F., Golamaully, F., Septier, G., Engelborghs, S., Vandenberghe, R., De Deyn, P. P., Fernadez, C. Muñoz, Benito, Y. Aladro, Thonberg, H., Forsell, C., Lilius, L., Kinhult-Stählbom, A., Kilander, L., Brundin, R. M., Concari, L., Helisalmi, S., Koivisto, A. Maria, Haapasalo, A., Dermecourt, V., Fievet, N., Hanon, O., Dufouil, C., Brice, A., Ritchie, K., Dubois, B., Himali, J. J., C Keene, D., Tschanz, J. A., Fitzpatrick, A. L., Kukull, W. A., Norton, M., Aspelund, T., Larson, E. B., Munger, R., Rotter, J. I., Lipton, R. B., Bullido, M. J., Hofman, A., Montine, T. J., Coto, E., Boerwinkle, E., Petersen, R. C., Alvarez, V., Rivadeneira, F., Reiman, E. M., Gallo, M., O'Donnell, C. J., Reisch, J. S., Bruni, A. Cecilia, Royall, D. R., Dichgans, M., Sano, M., Galimberti, D., St George-Hyslop, P., Scarpini, E., Tsuang, D. W., Mancuso, M., Bonuccelli, U., Winslow, A. R., Daniele, A., Wu, C. - K., Peters, O., Nacmias, B., Riemenschneider, M., Heun, R., Brayne, C., Rubinsztein, D. C., Brás, J., Guerreiro, R., Al-Chalabi, A., Shaw, C. E., Collinge, J., Mann, D., Tsolaki, M., Clarimón, J., Sussams, R., Lovestone, S., O'Donovan, M. C., Owen, M. J., Behrens, T. W., Mead, S., Goate, A. M., Uitterlinden, A. G., Holmes, C., Cruchaga, C., Ingelsson, M., Bennett, D. A., Powell, J., Golde, T. E., Graff, C., De Jager, P. L., Morgan, K., Ertekin-Taner, N., Combarros, O., Psaty, B. M., Passmore, P., Younkin, S. G., Berr, C., Gudnason, V., Rujescu, D., Dickson, D. W., Dartigues, J. - F., DeStefano, A. L., Ortega-Cubero, S., Hakonarson, H., Campion, D., Boada, M., Kauwe, J. Keoni, Farrer, L. A., Van Broeckhoven, C., M Ikram, A., Jones, L., Haines, J. L., Tzourio, C., Launer, L. J., Escott-Price, V., Mayeux, R., Deleuze, J. - F., Amin, N., Holmans, P. A., Pericak-Vance, M. A., Amouyel, P., van Duijn, C. M., Ramirez, A., San Wang, L. -, Lambert, J. - C., Seshadri, S., Williams, J., and Schellenberg, G. D., “Rare coding variants in PLCG2, ABI3, and TREM2 implicate microglial-mediated innate immunity in Alzheimer's disease.”, Nat Genet, vol. 49, no. 9, pp. 1373-1384, 2017.

C. Cruchaga, Karch, C. M., Jin, S. Chih, Benitez, B. A., Cai, Y., Guerreiro, R., Harari, O., Norton, J., Budde, J., Bertelsen, S., Jeng, A. T., Cooper, B., Skorupa, T., Carrell, D., Levitch, D., Hsu, S., Choi, J., Ryten, M., Sassi, C., Brás, J., Gibbs, R. J., Hernandez, D. G., Lupton, M. K., Powell, J., Forabosco, P., Ridge, P. G., Corcoran, C. D., Tschanz, J. A. T., Norton, M. C., Munger, R. G., Schmutz, C., Leary, M., F Demirci, Y., Bamne, M. N., Wang, X., Lopez, O. L., Ganguli, M., Medway, C., Turton, J., Lord, J., Braae, A., Barber, I., Brown, K., Pastor, P., Lorenzo-Betancor, O., Brkanac, Z., Scott, E., Topol, E., Morgan, K., Rogaeva, E., Singleton, A., Hardy, J., M Kamboh, I., St George-Hyslop, P., Cairns, N., Morris, J. C., Kauwe, J. S. K., and Goate, A. M., “Rare coding variants in the phospholipase D3 gene confer risk for Alzheimer's disease.”, Nature, vol. 505, no. 7484, pp. 550-554, 2014.

L. - San Wang, Naj, A. C., Graham, R. R., Crane, P. K., Kunkle, B. W., Cruchaga, C., Murcia, J. D. Gonzalez, Cannon-Albright, L., Baldwin, C. T., Zetterberg, H., Blennow, K., Kukull, W. A., Faber, K. M., Schupf, N., Norton, M. C., Tschanz, J. A. T., Munger, R. G., Corcoran, C. D., Rogaeva, E., Lin, C. - F., Dombroski, B. A., Cantwell, L. B., Partch, A., Valladares, O., Hakonarson, H., St George-Hyslop, P., Green, R. C., Goate, A. M., Foroud, T. M., Carney, R. M., Larson, E. B., Behrens, T. W., Kauwe, J. S. K., Haines, J. L., Farrer, L. A., Pericak-Vance, M. A., Mayeux, R., Schellenberg, G. D., Albert, M. S., Albin, R. L., Apostolova, L. G., Arnold, S. E., Barber, R., Barmada, M., Barnes, L. L., Beach, T. G., Becker, J. T., Beecham, G. W., Beekly, D., Bennett, D. A., Bigio, E. H., Bird, T. D., Blacker, D., Boeve, B. F., Bowen, J. D., Boxer, A., Burke, J. R., Buxbaum, J. D., Cairns, N. J., Cao, C., Carlson, C. S., Carroll, S. L., Chui, H. C., Clark, D. G., Cribbs, D. H., Crocco, E. A., DeCarli, C., DeKosky, S. T., F Demirci, Y., Dick, M., Dickson, D. W., Duara, R., Ertekin-Taner, N., Fallon, K. B., Farlow, M. R., Ferris, S., Frosch, M. P., Galasko, D. R., Ganguli, M., Gearing, M., Geschwind, D. H., Ghetti, B., Gilbert, J. R., Glass, J. D., Graff-Radford, N. R., Growdon, J. H., Hamilton, R. L., Hamilton-Nelson, K. L., Harrell, L. E., Head, E., Honig, L. S., Hulette, C. M., Hyman, B. T., Jarvik, G. P., Jicha, G. A., Jin, L. - W., Jun, G., Jun, G., M Kamboh, I., Karydas, A., Kaye, J. A., Kim, R., Koo, E. H., Kowall, N. W., Kramer, J. H., LaFerla, F. M., Lah, J. J., Leverenz, J. B., Levey, A. I., Li, G., Lieberman, A. P., Lopez, O. L., Lunetta, K. L., Lyketsos, C. G., Mack, W. J., Marson, D. C., Martin, E. R., Martiniuk, F., Mash, D. C., Masliah, E., McCormick, W. C., McCurry, S. M., McDavid, A. N., McKee, A. C., W Mesulam, M., Miller, B. L., Miller, C. A., Miller, J. W., Montine, T. J., Morris, J. C., Murrell, J. R., Olichney, J. M., Parisi, J. E., Perry, W., Peskind, E., Petersen, R. C., Pierce, A., Poon, W. W., Potter, H., Quinn, J. F., Raj, A., Raskind, M., Reiman, E. M., Reisberg, B., Reitz, C., Ringman, J. M., Roberson, E. D., Rosen, H. J., Rosenberg, R. N., Sano, M., Saykin, A. J., Schneider, J. A., Schneider, L. S., Seeley, W. W., Smith, A. G., Sonnen, J. A., Spina, S., Stern, R. A., Tanzi, R. E., Thornton-Wells, T. A., Trojanowski, J. Q., Troncoso, J. C., Tsuang, D. W., Van Deerlin, V. M., Van Eldik, L. J., Vardarajan, B. N., Vinters, H. V., Vonsattel, J. Paul, Weintraub, S., Welsh-Bohmer, K. A., Williamson, J., Wishnek, S., Woltjer, R. L., Wright, C. B., Younkin, S. G., Yu, C. - E., and Yu, L., “Rarity of the Alzheimer disease-protective APP A673T variant in the United States.”, JAMA Neurol, vol. 72, no. 2, pp. 209-16, 2015.

Y. - J. Li, Scott, W. K., Zhang, L., Lin, P. - I., Oliveira, S. A., Skelly, T., Doraiswamy, M. P., Welsh-Bohmer, K. A., Martin, E. R., Haines, J. L., Pericak-Vance, M. A., and Vance, J. M., “Revealing the role of glutathione S-transferase omega in age-at-onset of Alzheimer and Parkinson diseases.”, Neurobiol Aging, vol. 27, no. 8, pp. 1087-93, 2006.

R. C. Green, L Cupples, A., Go, R., Benke, K. S., Edeki, T., Griffith, P. A., Williams, M., Hipps, Y., Graff-Radford, N., Bachman, D., and Farrer, L. A., “Risk of dementia among white and African American relatives of patients with Alzheimer disease.”, JAMA, vol. 287, no. 3, pp. 329-36, 2002.

J. L. Del-Aguila, Li, Z., Dube, U., Mihindukulasuriya, K. A., Budde, J. P., Fernández, M. Victoria, Ibañez, L., Bradley, J., Wang, F., Bergmann, K., Davenport, R., Morris, J. C., Holtzman, D. M., Perrin, R. J., Benitez, B. A., Dougherty, J., Cruchaga, C., and Harari, O., “A single-nuclei RNA sequencing study of Mendelian and sporadic AD in the human brain.”, Alzheimers Res Ther, vol. 11, no. 1, p. 71, 2019.

M. Victoria Fernández, Black, K., Carrell, D., Saef, B., Budde, J., Deming, Y., Howells, B., Del-Aguila, J. L., Ma, S., Bi, C., Norton, J., Chasse, R., Morris, J., Goate, A., and Cruchaga, C., “SORL1 variants across Alzheimer's disease European American cohorts.”, Eur J Hum Genet, vol. 24, no. 12, pp. 1828-1830, 2016.

Y. Hu, Li, M., Lu, Q., Weng, H., Wang, J., Zekavat, S. M., Yu, Z., Li, B., Gu, J., Muchnik, S., Shi, Y., Kunkle, B. W., Mukherjee, S., Natarajan, P., Naj, A., Kuzma, A., Zhao, Y., Crane, P. K., Lu, H., and Zhao, H., “A statistical framework for cross-tissue transcriptome-wide association analysis.”, Nat Genet, vol. 51, no. 3, pp. 568-576, 2019.

C. A. Reynolds, Hong, M. - G., Eriksson, U. K., Blennow, K., Bennet, A. M., Johansson, B., Malmberg, B., Berg, S., Wiklund, F., Gatz, M., Pedersen, N. L., and Prince, J. A., “A survey of ABCA1 sequence variation confirms association with dementia.”, Hum Mutat, vol. 30, no. 9, pp. 1348-54, 2009.

A. J. Myers, J Gibbs, R., Webster, J. A., Rohrer, K., Zhao, A., Marlowe, L., Kaleem, M., Leung, D., Bryden, L., Nath, P., Zismann, V. L., Joshipura, K., Huentelman, M. J., Hu-Lince, D., Coon, K. D., Craig, D. W., Pearson, J. V., Holmans, P., Heward, C. B., Reiman, E. M., Stephan, D., and Hardy, J., “A survey of genetic human cortical gene expression.”, Nat Genet, vol. 39, no. 12, pp. 1494-9, 2007.

A. Amlie-Wolf, Ryvkin, P., Tong, R., Dragomir, I., Suh, E. R., Xu, Y., Van Deerlin, V. M., Gregory, B. D., Kwong, L. K., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. - Y., San Wang, L. -, and Lee, E. B., “Transcriptomic Changes Due to Cytoplasmic TDP-43 Expression Reveal Dysregulation of Histone Transcripts and Nuclear Chromatin.”, PLoS One, vol. 10, no. 10, p. e0141836, 2015.

G. R. Jun, Chung, J., Mez, J., Barber, R., Beecham, G. W., Bennett, D. A., Buxbaum, J. D., Byrd, G. S., Carrasquillo, M. M., Crane, P. K., Cruchaga, C., De Jager, P., Ertekin-Taner, N., Evans, D., M Fallin, D., Foroud, T. M., Friedland, R. P., Goate, A. M., Graff-Radford, N. R., Hendrie, H., Hall, K. S., Hamilton-Nelson, K. L., Inzelberg, R., M Kamboh, I., Kauwe, J. S. K., Kukull, W. A., Kunkle, B. W., Kuwano, R., Larson, E. B., Logue, M. W., Manly, J. J., Martin, E. R., Montine, T. J., Mukherjee, S., Naj, A., Reiman, E. M., Reitz, C., Sherva, R., St George-Hyslop, P. H., Thornton, T., Younkin, S. G., Vardarajan, B. N., San Wang, L. -, Wendlund, J. R., Winslow, A. R., Haines, J., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G., Lunetta, K. L., and Farrer, L. A., “Transethnic genome-wide scan identifies novel Alzheimer's disease loci.”, Alzheimers Dement, vol. 13, no. 7, pp. 727-738, 2017.

J. Mez, Chung, J., Jun, G., Kriegel, J., Bourlas, A. P., Sherva, R., Logue, M. W., Barnes, L. L., Bennett, D. A., Buxbaum, J. D., Byrd, G. S., Crane, P. K., Ertekin-Taner, N., Evans, D., M Fallin, D., Foroud, T., Goate, A., Graff-Radford, N. R., Hall, K. S., M Kamboh, I., Kukull, W. A., Larson, E. B., Manly, J. J., Haines, J. L., Mayeux, R., Pericak-Vance, M. A., Schellenberg, G. D., Lunetta, K. L., and Farrer, L. A., “Two novel loci, COBL and SLC10A2, for Alzheimer's disease in African Americans.”, Alzheimers Dement, vol. 13, no. 2, pp. 119-129, 2017.

M. A. Slifer, Martin, E. R., Haines, J. L., and Pericak-Vance, M. A., “The ubiquilin 1 gene and Alzheimer's disease.”, N Engl J Med, vol. 352, no. 26, pp. 2752-3; author reply 2752-3, 2005.

S. Smemo, Nowotny, P., Hinrichs, A. L., Kauwe, J. S. K., Cherny, S., Erickson, K., Myers, A. J., Kaleem, M., Marlowe, L., Gibson, A. M., Hollingworth, P., O'Donovan, M. C., Morris, C. M., Holmans, P., Lovestone, S., Morris, J. C., Thal, L., Li, Y., Grupe, A., Hardy, J., Owen, M. J., Williams, J., and Goate, A., “Ubiquilin 1 polymorphisms are not associated with late-onset Alzheimer's disease.”, Ann Neurol, vol. 59, no. 1, pp. 21-6, 2006.

P. Ryvkin, Leung, Y. Yee, Ungar, L. H., Gregory, B. D., and San Wang, L. -, “Using machine learning and high-throughput RNA sequencing to classify the precursors of small non-coding RNAs.”, Methods, vol. 67, no. 1, pp. 28-35, 2014.